AtomからRを使うための設定（Ubuntu系OS）

お気に入りのエディタからなにがなんでも出たくないという病気。
ここ3年はAtom推しなので，今回はAtomからRを使用する環境を作る。

環境は，Lubuntu 18.04 LTS。
でも別にこのOSがなにか特別なわけじゃない。

これまでAtomからRを使うときは，Atomのパッケージである，

language-r
autocomplete-r
build-rscript

などといったものを使っていた。
詳しくは，こちらの記事の通りに。

Atom - RjpWiki

というか，buildがめんどくさくて，もうterminalをペインに開いて打っていたけど。

でも最近，Atomでrboxというパッケージができたらしい。
これはちょっと便利そうじゃないのー。

atom.io

基本的な方針としては，

Rをインストール
Jupyterをインストール
Atomをインストール
JupyterにR言語を対応させる
AtomにJupyterを対応させる

というような手順。Jupyterを経由するという発想。

JupyterとRの対応は，RからIRkernelを入れる
AtomとJupyterの対応は，AtomからHydrogenを入れる
最後にrboxを入れる

ま，そのままJupyterを使ってもいいんだけど，個人的にAtomでやりたい。

さて，順番にコードを書いていく。

コンソールからRを入れる

sudo apt-get install r-base-core

Jupyterを入れる

sudo apt-get install jupyter

Atomを入れる

sudo add-apt-repository ppa:webupd8team/atom
sudo apt-get update
sudo apt-get install atom

IRKernelのための準備

sudo apt-get install libzmq3-dev libcurl4-openssl1.dev libssl-dev

（なんかココ変だな，Rのdevtoolsはcurlがないと入らないのだけど，curlは依存関係があるようだ。もしだめだったら,libcurl3とかを先にいれないとだめかも。で，libcurl-openssl1.0-devを最後に入れるのかな？）

RからIRKernel関連を入れる

install.packages(c('crayon', 'pbdZMQ', 'devtools'))
devtools::install_github(paste0('IRkernel/', c('repr', 'IRdisplay', 'IRkernel')))
library(IRkernel)
IRkernel::installspec()

Installation · IRkernel

これでJupyterとは対応されるはず。

jupyter-notebook

と打って，ブラウザ上からNewを開いて，Rが追加されていることを確認。
あとは，Atom上で以下のパッケージを入れる

rbox
hydrogen
atom-beautify
termination

これでOKなはず。

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